文件名称：TNBC_analysis:复制TNBC分析和数字的代码
文件大小：1.5MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-01 18:40:06
R
介绍 带有文章补充代码的存储库： 三阴性乳腺癌的蛋白质组学分析确定亚型特异性治疗脆弱性和表观遗传学免疫抑制 作者 安东尼奥·科拉普里科（Antonio Colaprico） 布莱恩·莱曼（Brian D.Lehmann） 蒂亚戈·席尔瓦（Tiago C. Silva） 陈锡生 文件夹和文件结构 01_data_download.R ：下载分析中使用的大多数数据 data:包含分析代码使用的，未使用01_data_download.R检索的01_data_download.R analysis/TCGA:包含用于执行大部分TCGA分析的代码 analysis/CPTAC:包含用于执行大部分CPTAC分析的代码 analysis/PDTX:包含用于执行大部分PDTX分析的代码 analysis/depmap ：包含用于执行大部分DepMap（癌症依赖图项目）分析的代码 analysi
【文件预览】：
TNBC_analysis-master
----data()
--------CPTAC_GENES_v5.2.csv(2KB)
--------RPPA_fig1_genes.csv(1KB)
--------TCGA_REVISED_Table_S2_TNBCsubtype clinical information and signatures.csv(280KB)
--------gene_list_cna_mutation_fig1B.csv(1KB)
--------CPTAC()
--------GISTIC()
----analysis()
--------PDTX()
--------GDSC()
--------depmap()
--------TCGA()
----README.md(1KB)
----01_data_download.R(17KB)