本科研究

【文件属性】：
文件名称：本科研究
文件大小：18KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-25 07:23:20
Python 命令行BLAST生成文本文件作为输出。 BLAST_to_Excel.py从这些文本文件中收集数据，并将它们组织到Excel电子表格中的表中。 它为每个属创建一个单独的Excel文件。 每个文件中都有该属中每个物种的表。 它的格式为表格，列A到K。列A具有样品名称（基本上是运行BLAST的文件），列B指示样品检测的衣原体是阳性还是阴性。 C列具有通过Kraken软件识别的该物种的多少个读数，而D列具有通过BLAST确认为该物种的那些读数的多少。 E列包含每次读取的前4个BLAST命中结果，除非找到该物种。 例如，如果我们查看的是沙眼衣原体提取的读段，而沙眼衣原体是BLAST中的第6个匹配项，则列E将列出前6个匹配项。 G和H列分别是得分和支持的e值，列出了每个匹配结果的这些特征。 F，I和J列，区域/ CDS，同一性百分比和馏分同一性分别总结了来自比对部分的信息。 最后，列K具有读取的长度

【文件预览】：
undergrad-research-main
----Zoonotic_Excel.py(11KB)
----README.md(3KB)
----Excel_Summary.py(10KB)
----GR_extraction_FASTA.py(9KB)
----BLAST_to_Excel.py(13KB)
----Zoonotic_Summary.py(7KB)
----GR_extraction_FASTQ.py(9KB)