文件名称:FateTracking:跟踪和分类细胞类型的工具
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更新时间:2024-03-04 04:40:39
JupyterNotebook
命运追踪 跟踪和分类类器官单层细胞状态的工具。 管道摘要 稳定和降噪 分割 特征提取 联系 分类-将静态和动态特征与训练数据进行比较,以确定细胞类型。 要求 核荧光通道中的类器官单层的TIFF堆栈(穿越时间的堆栈)和birghtfield或相衬。 包含时间信息的元数据文件 程序 创建conda环境: $ conda env create -f environment.yml 编辑配置文件以包括相关信息: