【文件属性】:
文件名称:FateTracking:跟踪和分类细胞类型的工具
文件大小:1.21GB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-12 10:53:59
JupyterNotebook
命运追踪
跟踪和分类类器官单层细胞状态的工具。
管道摘要
稳定和降噪
分割
特征提取
联系
分类-将静态和动态特征与训练数据进行比较,以确定细胞类型。
要求
核荧光通道中的类器官单层的TIFF堆栈(穿越时间的堆栈)和birghtfield或相衬。
包含时间信息的元数据文件
程序
创建conda环境:
$ conda env create -f environment.yml
编辑配置文件以包括相关信息: