sff2fastq:提取454 Genome Sequencer从SFF文件中读取并将其转换为FASTQ格式的输出

时间:2024-06-03 01:57:59
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文件名称:sff2fastq:提取454 Genome Sequencer从SFF文件中读取并将其转换为FASTQ格式的输出

文件大小:10KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-03 01:57:59

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概要 程序sff2fastq从454基因组测序仪产生的SFF文件中提取读取的信息,并以FASTQ格式输出序列和质量得分。 用法 给定一个SFF文件file.sff您可以简单地运行: sff2fastq file.sff 如果未在命令行上指定SFF文件,则sff2fastq还将从标准输入中读取。 例如,您可以执行以下操作: cat file.sff | sff2fastq > file.fastq 如果您有压缩的sff文件,并且想要避免像这样创建临时文件,这将很有用: zcat file.sff.gz | sff2fastq > file.fastq (该功能已通过了麻烦加入) 选项 以下是帮助消息(通过sff2fastq -h ),描述了其用法和选项: Usage: sff2fastq [options] [sff_file] -h


【文件预览】:
sff2fastq-master
----endian.h(3KB)
----sff.h(5KB)
----README.md(3KB)
----Makefile(445B)
----sff.c(12KB)
----main.c(8KB)

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