文件名称：oeante:Antechamber（AMBER GAFF 参数化引擎）使用 OpenEye 工具实现
文件大小：84KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-29 02:42:56
Python
奥安特 Antechamber（AMBER GAFF 参数化引擎）使用 OpenEye 工具实现 Richard Dixon 的原始代码，作为 GPLv2 发布： : 介绍 Antechamber 是一组程序，旨在减轻与使用 Amber 力场和程序设置和运行新分子相关的痛苦。 在诸如前厅之类的程序支持之前，一般程序是 a) 以临时方式从相关分子中手动选择参数或 b) 花费大量时间运行 QM 计算。 通过选项 b) 得出的结构参数通常与从选项 a) 中获得的参数一致，表明整个过程可以自动化。 结合其他力场中使用的许多参数估计方案，特别是 mmff94、uff 和 mm2，创建了第三种类型的参数生成。 如果选项 a) 可以被描述为“临时”而选项 b) 可以被描述为“严格”，则选项 c) 是半严格的。 参数生成方案确实考虑了新分子的化学环境，但最终会调用基于规则的程序来分配值。 为了安慰
【文件预览】：
oeante-master
----.travis.yml(515B)
----LICENSE(17KB)
----oeante()
--------__init__.py(0B)
--------oeparmchk.py(50KB)
--------gaff()
--------oeante.py(17KB)
----setup.py(1KB)
----README.md(6KB)
----tests()
--------min.in(238B)