文件名称:FuzzyForest:[开发中]随机分类和回归树
文件大小:8.22MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-23 03:08:33
R
fuzzyforest fuzzyforest是随机林的扩展,旨在在要素相互关联时产生较少的偏差变量重要性等级。 该算法要求将特征划分为单独的组或模块,以使组内的相关性大而组间的相关性小。 fuzzyforest允许与WGCNA软件包轻松集成。 可以从CRAN下载最新发布的版本: install.packages("fuzzyforest") 可以从github下载最新的开发版本: install_github("OHDSI/FuzzyForest") 为了能够使用的全部功能fuzzyforest ,包WGCNA必须安装。 但是, WGCNA需要安装一些来自bioConductor的软件包。 要安装WGCNA ,请在控制台中输入以下几行: setRepositories(ind=1:2) install.packages("WGCNA") source("http://bio
【文件预览】:
FuzzyForest-master
----man()
--------predict.fuzzy_forest.Rd(779B)
--------fuzzyforest.Rd(389B)
--------print.fuzzy_forest.Rd(620B)
--------Liver_Expr.Rd(816B)
--------example_ff.Rd(435B)
--------ff.Rd(4KB)
--------screen_control.Rd(2KB)
--------select_RF.Rd(2KB)
--------modplot.Rd(860B)
--------wff.Rd(4KB)
--------fuzzy_forest.Rd(945B)
--------relabel_modules.Rd(701B)
--------tune_mtry.Rd(1KB)
--------iterative_RF.Rd(1KB)
--------select_control.Rd(2KB)
--------WGCNA_control.Rd(1KB)
--------ctg.Rd(556B)
----.gitignore(78B)
----README.md(1KB)
----.Rbuildignore(68B)
----vignettes()
--------fuzzyforest_introduction.Rmd(10KB)
----data-raw()
--------ctg.RData(3KB)
--------CTGexport.csv(161KB)
--------ClinicalTraits.csv(83KB)
--------vignette_code.R(3KB)
--------GeneAnnotation.csv(12.52MB)
--------LiverFemale3600.csv(4.64MB)
--------rf_cv.RData(469B)
--------Liver_Expr.RData(677KB)
--------analysis.R(17KB)
--------geneInfo.csv(2.78MB)
--------WGCNA_dat_processing.R(7KB)
----DESCRIPTION(594B)
----FuzzyForest.Rproj(413B)
----inst()
--------CITATION(631B)
----R()
--------onAttach.R(747B)
--------fuzzy_forest_obj.R(7KB)
--------fuzzyforest.R(2KB)
--------tuning_functions.R(3KB)
--------iterative_RF.R(8KB)
--------fuzzyforest_fit.R(18KB)
--------tuning_parameters.R(6KB)
----cran_comments.md(552B)
----data()
--------ctg.RData(3KB)
--------Liver_Expr.rda(556KB)
--------example_ff.RData(43KB)
----NAMESPACE(314B)