archive-genevieve-201505:(存档)以前尝试创建一个开源工具来了解遗传变异的影响

时间:2024-06-25 02:51:03
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更新时间:2024-06-25 02:51:03

Python

吉纳维芙 Genevieve 正在开发为一种开源工具,用于了解遗传变异的影响。 每个变体的解释可由用户编辑以形成共识理解,通常基于现有文献和其他公共资源。 Genevieve 的灵感直接来自之前使用的开源网站。 Genevieve 还允许用户上传基因组并创建基因组报告,总结给定基因组内的显着变异。 Genevieve 的变异数据库和基因组报告目前仅限于了解列出的。 安装 这些说明是为 Ubuntu Linux 13.10 或 14.04 编写的。 克隆 Git 存储库 导航到您想要将代码放入的目录,并使用以下命令克隆存储库: git clone git://github.com/PersonalGenomesOrg/genevieve 。 添加预期的额外数据文件 Genevieve 需要以下数据来解释完整基因组学 var 文件: 转到data_files/目录 通过键入以下内容将hg


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