文件名称：consistency-analysis
文件大小：1.51MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-21 12:32:54
Python
一致性分析 一致性分析是作为基于约束的建模工具箱cobrapy（ ）的扩展而开发的一组工具。 它允许执行： 基因组规模代谢模型的一致性分析。 填补被阻止的React。 元模型的构建。 包装依赖性： 眼镜蛇： : 。 Networkx库： ://networkx.github.io/。 安装： 一致性分析不需要安装。 如果您在科学出版物中使用一致性分析，请引用 执照 一致性分析源是根据GPL许可发布的。 该程序是免费软件：您可以根据*软件基金会发布的GNU通用公共许可证的条款，重新分发和/或修改它。 分发该程序是希望它会有用，但是没有任何保证； 甚至没有对适销性或特定用途适用性的暗示保证。 有关更多详细信息，请参见GNU通用公共许可证。
【文件预览】：
consistency-analysis-master
----.gitignore(12B)
----join_models.py(5KB)
----outputs()
--------Opt171101_1_Gap_graph.gml(201KB)
--------Opt171101_1_GAPS_METAB.csv(4KB)
--------Opt171101_1_BLK_RXNS.csv(3KB)
--------Opt171101_1_UMS.csv(7KB)
----parameters_MM130.1_gurobi.json(494B)
----LICENSE(18KB)
----script_gapfill_model.py(9KB)
----script_consistency_analysis.py(5KB)
----README.md(1KB)
----parameters_MM166.1_gurobi.json(489B)
----Data()
--------seed_reactions_tab.csv(1.91MB)
--------MM130.1.xml(3.96MB)
--------MM130.1.fctab.npy(56.28MB)
--------rxn2ec.csv(45KB)
--------seed_compounds_tab.csv(871KB)
--------MM166.1.xml(4.01MB)
--------Taxonomy.csv(10KB)
----modules()
--------modular_gap_find.py(4KB)
--------__init__.py(1B)
--------utils.py(9KB)
--------settings.py(3KB)
--------fastcore.py(11KB)
----script_create_metamodel.py(2KB)
----test()
--------Seed176299.3.xml(2.16MB)
--------Opt171101_1.xml(1.13MB)
--------Opt83333_1.xml(2.17MB)