文件名称：MetaBGC:利用人类微生物组化学库的宏基因组学策略
文件大小：34.46MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-23 10:37:27
Python
MetaBGC：生物合成基因簇的元基因组标识符 MetaBGC是一种基于读取的算法，可直接在宏基因组测序数据中检测生物合成基因簇（BGC）。 出版物 有关详细说明和有关引用MetaBGC的信息，请参见。 入门 这些说明将使您设置为在本地Linux或Apple环境中运行MetaBGC。 重要笔记 用户可以使用提供的玩具数据集测试管道。 考虑到宏基因组数据集中很少有环化酶，因此无法对提供的测试环化酶模型运行自己的读取库。 对于非环化酶spHMM，您可以从头开始使用构建模块创建自己的模块。 此外，我们目前正在为其他几种生物合成类开发高性能spHMM，并将在几个月后（作为预建模型）在后续发行/发布中发行它们。 Bioconda分布 即将推出... 手动安装 先决条件 要运行MetaBGC，请确保已在PATH中安装了以下依赖项。 （版本> = 3.6） 版本3.1b2 4.7版