pipelines:各种本地任务的bash脚本和管道

时间:2024-06-04 19:58:08
【文件属性】:

文件名称:pipelines:各种本地任务的bash脚本和管道

文件大小:16KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-04 19:58:08

Shell

这些是我本地消费的肮脏脚本。 如果可以适用于一般任务,我可以概括一些并整理一下。


【文件预览】:
pipelines-master
----get_tags.per.isolate.sh(287B)
----.gitignore(12B)
----merge.sh(188B)
----quitapp.sh(7KB)
----splice_alignment.sh(278B)
----extract_seqs_per_colony.sh(663B)
----servers.sh(167B)
----ebola_project()
----map_variants.sh(2KB)
----run_uclust.sh(1KB)
----within_isolate_clustering.sh(387B)
----count.polymorphisms.sh(1KB)
----assemble_tracedata.sh(3KB)
----README.md(124B)
----blast_similarity_graph.sh(2KB)
----clustering_pipeline.sh(4KB)
----assemble.sh(4KB)
----region_summaries.sh(797B)
----update_gems.sh(62B)
----simulate.sh(1KB)
----cluster_coverage.sh(140B)
----find_snps_in_blocks.sh(156B)
----snp_density.sh(1KB)
----epitope_pipeline.sh(1KB)

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