文件名称：seeq:DNARNA模式匹配算法
文件大小：1.66MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-31 18:15:39
C
Seeq：DNA / RNA模式匹配算法 内容： 1. What is seeq? 2. Source file list. 3. Compilation and installation. 4. Running seeq. 5. Using seeq as a sequence trimmer. 6. License. 7. References. I.什么是seeq？ Seeq是一种DNA / RNA模式匹配算法。 序列匹配是基于Levenshtein距离度量[1]执行的。 通常，包含DNA序列的文件与DNA模式一起作为输入传递。 Seeq将搜索包含匹配模式的行。 默认情况下，Seeq通过标准输出返回匹配的行。 Seeq还有许多其他应用程序，例如序列提取，序列修整等。 二。 源文件列表 src / main-seeq.c Seeq主文件（参数解析）。 src / seeq.c主要
【文件预览】：
seeq-master
----setup.py(689B)
----.gitignore(129B)
----Makefile(2KB)
----test.txt(257B)
----src()
--------seeq-main.c(13KB)
--------libseeq.h(2KB)
--------libseeq.c(38KB)
--------seeq.c(13KB)
--------seeqmodule.c(32KB)
--------seeqcore.h(4KB)
--------seeq.h(2KB)
----.travis.yml(325B)
----LICENSE(34KB)
----doc()
--------fig_methods.pdf(305KB)
--------Figure_1.pdf(284KB)
--------missfont.log(80B)
--------stfloats.sty(10KB)
--------alltt.sty(3KB)
--------landscap.sty(187B)
--------results.pdf(46KB)
--------document.dvi(22KB)
--------document.log(20KB)
--------response.aux(2KB)
--------natbib.sty(34KB)
--------color.sty(6KB)
--------array.sty(13KB)
--------url.sty(15KB)
--------flushend.sty(5KB)
--------document.blg(892B)
--------float.sty(7KB)
--------response.log(9KB)
--------document.aux(2KB)
--------graphicx.sty(8KB)
--------sparsity_of_the_DFA.pdf(411KB)
--------crop.sty(13KB)
--------chngpage.sty(11KB)
--------document.pdf(438KB)
--------myers_bit_vector.c(2KB)
--------document.bbl(2KB)
--------crop.cfg(2KB)
--------document.bib(4KB)
--------bioinfo.cls(29KB)
--------documentation.doc(27KB)
--------natbib.bst(26KB)
--------PLAIN.BST(21KB)
--------times.sty(693B)
--------edit_matrix.pdf(306KB)
--------response.tex(18KB)
--------document.tex(10KB)
----README.md(7KB)
----test()
--------python_lib_test.py(1KB)
--------faultymalloc.c(1KB)
--------Makefile(1002B)
--------faultymalloc.h(66B)
--------debug.gdb(2B)
--------testdata.txt(79B)
--------testset.c(38KB)