文件名称：parapred:使用深度学习的对位预测
文件大小：3.49MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-23 09:06:21
python machine-learning neural-network protein-structure lstm
Parapred ---抗体结合残基预测 在描述的方法的原始实现 安装 要求： Python 3.6+（或仅运行预测器的Python 2.7） 安装： 在根目录中运行python setup.py install 。 如果您使用的是Python安装管理器（例如Anaconda或Canopy），请按照其软件包安装说明进行操作。 如果您不想直接从此存储库的克隆安装并运行Parapred，请使用pip install -r requirements.txt安装所需的软件包。 用法 如果已安装，则Parapred应该仅可以在命令行上作为parapred可执行文件使用（运行parapred --help进行检查）。 如果选择直接运行Parapred，请确保已从requirements.txt安装了必需的软件包，然后尝试在此存储库的根目录中执行python -m parapred --hel
【文件预览】：
parapred-master
----parapred()
--------full_seq_processor.py(8KB)
--------dev_runner.py(9KB)
--------patchdock_tools.py(5KB)
--------plotting.py(5KB)
--------parapred.py(9KB)
--------scrape.py(2KB)
--------model.py(4KB)
--------structure_processor.py(7KB)
--------precomputed()
--------__init__.py(0B)
--------evaluation.py(10KB)
--------__main__.py(34B)
--------data()
--------data_provider.py(6KB)
----.gitignore(156B)
----setup.cfg(26B)
----README.md(5KB)
----parapred-runner.py(94B)
----LICENSE(1KB)
----requirements.txt(414B)
----setup.py(796B)
----parapred-dev-run.py(96B)