文件名称：SOPRA for scaffolding
文件大小：610KB
文件格式：ZIP
更新时间：2016-06-23 20:33:30
SOPRA scaffolding
Assembler for mate pair/paired-end reads from high throughput sequencing platforms, e.g. Illumina and SOLiD.
【文件预览】：
document_v1.4.6.pdf
source_codes_v1.4.6
----SOPRA_integrated_with_SSAKE()
--------ss_scaf_v1.4.6.pl(139KB)
--------ss_contig_col_v1.4.6.pl(89KB)
--------ss_contig_base_v1.4.6.pl(73KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------ss_format_base_v1.4.6.pl(4KB)
--------ss_format_col_v1.4.6.pl(4KB)
----SOPRA_integrated_with_Velvet()
--------format_base_v1.4.6.pl(4KB)
--------format_col_v1.4.6.pl(4KB)
--------vs_contig_base_v1.4.6.pl(36KB)
--------vs_scaf_v1.4.6.pl(137KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------vs_contig_col_v1.4.6.pl(42KB)
----SOLiD_related_scripts()
--------postprocessor_documentation.pdf(106KB)
--------preprocessor_documentation.pdf(101KB)
--------solid_denovo_preprocessor.pl(7KB)
--------solid_denovo_postprocessor.pl(6KB)
----.DS_Store(15KB)
----SOPRA_with_prebuilt_contigs()
--------s_read_parsed_sam_v1.4.6.pl(21KB)
--------s_prep_contigAseq_v1.4.6.pl(8KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------s_parse_sam_v1.4.6.pl(18KB)
--------s_scaf_v1.4.6.pl(147KB)
----SOLiD_filter()
--------SOLiD_preprocess_meanFilter_SOPRA_v1.pl(46KB)