文件名称：matlab说话代码-PennSort:穗分拣软件
文件大小：99KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 03:25:11
系统开源
matlab说话代码潘恩·索特 穗分拣软件 安装 将/ SpikeSort及其所有子文件夹添加到MATLAB路径。 混合/ Spike Fitting / reconstructSpike.c 将/Clustering/ascii2dump.c和/Clustering/optics.cc编译为独立的可执行文件。 使用新的MEA时，有必要创建“几何”功能。 有关示例，请参阅Arrays / 2F30EL / geom_2F30EL.m和Arrays / 256 / geom_256.m。 这应该以电极组编号为输入，并返回该组中所有电极的xy坐标矩阵。 它还应返回一个单元阵列ChannelGroups，列出属于每个组的所有电极编号。 然后，应将此几何函数输入SpikeSort.m中“数组”变量的构造函数中。 为您的数据编写一个加载函数。 它应采用原始数据文件名，并返回一个Matlab数组，其行是每个通道的时间序列。 它应该执行您认为必要的任何过滤。 有关我们的数据，请参见“ new_LoadAndFilterPenn.m”。然后必须将此函数分配给SpikeSort.m中的变量“ loadf
【文件预览】：
PennSort-master
----.gitignore(246B)
----Installation.txt(5KB)
----Clustering()
--------order_points.m(4KB)
--------clustersplit.fig(9KB)
--------write_ascii_for_optics.m(352B)
--------makeTemplates.m(10KB)
--------ascii2dump(9KB)
--------plots.fig(11KB)
--------optics(43KB)
--------clustersplit.m(15KB)
--------plots.m(27KB)
--------show_overlapping_templates.m(3KB)
--------~ascii2dump(13KB)
--------optics.cc(29KB)
--------poormansoptics.m(1007B)
--------ascii2dump.c(2KB)
----SecondPass.m(2KB)
----LICENSE(1KB)
----Spike Extraction()
--------loadTetrodeData.m(64B)
--------HighPassFilter.m(449B)
--------new_Penn_read_lv_header.m~(2KB)
--------ReadLVString.m(236B)
--------new_Penn_read_lv_header.m(2KB)
--------extractSpikes.m(7KB)
--------new_LoadAndFilterPenn.m(2KB)
--------StopFilterData.mat(992B)
--------Filter.mat(1KB)
--------DataLowPassFilter.m(246B)
----README.md(11KB)
----Statistics()
--------getNoiseAndWhiteningFilter.m(2KB)
--------getCorrFit.m(863B)
--------updateClusterStats.m(812B)
----SpikeSort.m(6KB)
----Instructions.txt(6KB)
----Spike Fitting()
--------preFit.m(3KB)
--------cmultifit.m(13KB)
--------reconstructSpike.c(2KB)
--------reconstructSpike.mexmaci(12KB)
----Arrays()
--------show_waveforms.m(1KB)
--------2F30EL()
--------@MEA()
--------tetrode()
--------256()