文件名称:机动包装
文件大小:10KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-28 17:00:02
Python
机动包装 MotEvo文件的简单Python解析器。 要安装,请运行: pip install motevowrapper MotEvo (Arnold等人,2012)是一种贝叶斯概率模型,用于预测给定位置权重矩阵(PWM)和DNA序列的转录因子结合位点(TFBS)。 它是由Biozentrum(瑞士巴塞尔大学)的van Nimwegen实验室开发的,可以在。 该存储库包含一个简单的Python软件包的源代码,该软件包可让您: 使用给定参数运行MotEvo 解析MotEvo输出文件 可视化每个图案的站点密度 从MotevoWrapper运行MotEvo 去做 从MotevoWrapper解析MotEvo文件 MotEvo产生2个文件: sites和priors文件。 包的用法很简单。 对于存储在/path/to/sites_MOTIF.wm的给定MotEvo网站文件,请调用
【文件预览】:
motevowrapper-main
----setup.cfg(39B)
----requirements.txt(15B)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(78B)
----motevowrapper()
--------motevowrapper.py(7KB)
--------tests()
--------__main__.py(92B)
--------__init__.py(69B)
--------_version.py(18B)
----README.md(2KB)
----LICENSE.txt(1KB)