GFP细胞检测

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文件名称：GFP细胞检测
文件大小：3.82MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-27 01:23:04
MATLAB GFP细胞检测 运行脚本“ sh run_script.sh $ brainID”以获取结果。 本文的代码回购： Sukhendu Das，Jaikishan Jayakumar，Samik Banerjee，Janani Ramaswamy，Venu Vangala，Keerthi Ram和Partha Mitra。 BioRxiv（2019）：252247。 构型 将输入的Brain图像以JP2格式存储，并在带有BrainID的文件夹中的名称中包含字母F（代表荧光部分）。 如果您有“脑区域分割”（如.mat文件），请将其存储在文件夹$ brainID / reg_high_seg_pad /中 如果您有其他格式的“脑区域分割”，请正确阅读该分割，以使其代表GFP_Cell_Detection / main_bam.m的第28行中的单通道图像 如果没有“脑区域分割”，请注释掉GF

【文件预览】：
GFP-Cell-Detection-main
----run_script.sh(126B)
----GFP_Cell_Detection()
--------main.m(3KB)
--------residue1.m(2KB)
--------cell_filling.m(2KB)
--------main_bam.m(5KB)
--------cluster.m(949B)
--------residue.m(2KB)
--------zcc.m(554B)
--------gfp_main.m(1KB)
--------gaussFun.m(507B)
--------Vessels.m(1022B)
--------pre_proc.m(629B)
--------phase1.m(3KB)
--------eval_pts.m(874B)
--------edge_layers.m(1KB)
--------fit_circles.m(1KB)
--------Evaluation()
--------frangi_filter_version2a()
--------run_script.sh(124B)
--------Euclidean_Signature.m(2KB)
--------normal.m(657B)
--------phase2.m(2KB)
--------circfit.m(589B)
--------weighted_pr_recall_gfp.m(4KB)
--------README.md(307B)
--------fit_circles.asv(1KB)
--------swap.m(120B)
----README.md(1KB)