文件名称:pymol-binder:可以通过MyBinder.org运行PyMol
文件大小:7.74MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-22 04:48:34
JupyterNotebook
pymol-binder 可以通过MyBinder.org运行PyMOL。 单击此页面上的“启动活页夹”徽章以启动活动会话,在该会话中,PyMOL和必需的依赖项被设置为运行。 此存储库旨在允许运行PyMOL而不使用桌面应用程序的典型图形用户界面(GUI) ,而可以使用命令行/脚本无头运行。 虽然这不允许在PyMOL桌面使用中常见的交互式探索,但是在没有GUI的情况下仍然可以执行许多其他交互,例如从分子结构文件中提取细节或渲染单个静态图像或多个图像帧以合成电影或动画。 (如果您需要典型的PyMOL桌面应用程序而无需用户在自己的计算机上安装,请参见。) 在已启动的会话中可用的笔记本电脑演示了如何做事。 您可以将这些示例用作指导,然后分析并制作您感兴趣的分子的图像或电影/动画。 资源 (请注意,这似乎并不包括实用程序库的命令,例如 ,实际上,我只能在PyMOL文档中找到。) 列出了
【文件预览】:
pymol-binder-master
----.gitignore(387B)
----postBuild(326B)
----LICENSE(1KB)
----doc()
--------img_18w_label.png(231KB)
--------color_combo_example.gif(281KB)
----notebooks()
--------demo_orient.ipynb(211KB)
--------illustrate_std_demo.ipynb(591KB)
--------demo_palette.ipynb(7.35MB)
--------demo_fetch.ipynb(836KB)
--------demo_colors.ipynb(287KB)
--------demo_residue_secondary_structure.ipynb(18KB)
--------demo_apply_combo.ipynb(345KB)
----README.md(5KB)
----environment.yml(232B)
----apt.txt(81B)
----index.ipynb(95KB)