ClusterMap:ClusterMap是一个R包,用于分析和比较两个或多个单细胞表达数据集

时间:2024-03-10 11:38:38
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文件名称:ClusterMap:ClusterMap是一个R包,用于分析和比较两个或多个单细胞表达数据集

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更新时间:2024-03-10 11:38:38

R

集群图 ClusterMap是一个R包,旨在分析和比较两个或多个单细胞表达数据集。 请引用:高X,胡D,果果M,李H。ClusterMap:比较不同实验条件下的多个单细胞RNA-Seq数据集。 生物信息学。 2019. doi:10.1093 / bioinformatics / btz024。 安装 R(> = 3.4.3),Seurat(> = 2.2.1),pheatmap(> = 1.0.10),ape(> = 5.1),circlize(> = 0.4.3) install_github( ' devtools ' ) library( ' devtools ' ) install_github( " xgaoo/ClusterMap " ) library( ' ClusterMap ' ) 教程


【文件预览】:
ClusterMap-master
----man()
--------separability.Rd(646B)
--------cluster_map_by_marker.Rd(785B)
--------inter_dist.Rd(480B)
--------inna_dist.Rd(462B)
--------purity_cut.Rd(479B)
--------make_single_obj.Rd(608B)
--------cluster_map.Rd(2KB)
--------recolor_s.Rd(760B)
--------add_perc.Rd(503B)
--------separability_by_group.Rd(827B)
--------circos_map.Rd(837B)
--------make_comb_obj.Rd(724B)
--------recolor_comb.Rd(988B)
--------separability_pairwise.Rd(829B)
----NAMESPACE(792B)
----LICENSE(36B)
----ClusterMap.Rproj(356B)
----R()
--------circos_map.R(5KB)
--------recolor.R(8KB)
--------cluster_map.R(6KB)
--------master.R(5KB)
--------pre_analysis.R(2KB)
--------separability.R(5KB)
----DESCRIPTION(425B)
----README.md(619B)
----ClusterMap-manual.pdf(72KB)

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