文件名称：attractors-search:搜索任何吸引子
文件大小：603KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-07 17:25:03
Python
1：对Rna.Seq的值进行二值化 以下过程显示了通过二值化技术将RNa-Seq的值转换为布尔值（0，1）的步骤。 TRIB3文本文件表示要转换的Rna-Seq值，其中的列表示表达的基因（在这种情况下为TRIB3），每一行描述了来自给定患者的每个单个分析细胞的Rna-Seq水平。 使用R脚本“ Binarize.R”处理文本文件“ TRIB3.txt”，将自动为存档中的每个单元获取与对应于给定基因的Rna-Seq数据有关的布尔值。 2：研究网吸引者 对与组成待分析网络的基因相对应的每个单个细胞的Rna-Seq值进行二值化处理后，我们继续搜索源自网络动态的任何吸引子。 “ attractors.py”脚本允许实现这一点。 请注意，此脚本适用于python 2.7版。 必须针对每个先前已二值化的Rna-Seq值已知的单个精细单元进行吸引子的搜索。 在布尔值等于“ 1”，“ False”的情
【文件预览】：
attractors-search-main
----attractors.py(7KB)
----TRIB3.txt(2KB)
----Binarize.R(299B)
----README.md(2KB)
----supplementary table()
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_2.xlsx(13KB)
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_3.xlsx(10KB)
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_5.xlsx(12KB)
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_1.xlsx(351KB)
--------README.md(1B)
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_7.xlsx(188KB)
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_6.xlsx(169KB)
--------SUPPLEMENTARY_TABLE_4.xlsx(47KB)