文件名称：inGAP-family-开源
文件大小：39.85MB
文件格式：TGZ
更新时间：2024-07-18 09:00:46
开源软件
inGAP-family 提供了一个高效和有效的框架来发现、过滤和可视化 DNA 多态性和结构变体，从短读序列的比对。 将此方法应用于真实数据集的多态性检测表明，消除人工变异极大地促进了减数分裂重组点的精确识别，识别突变基因组或 QTL 位点中的因果突变。 此外，inGAP-family 提供了用户友好的图形界面，用于检测多态性和结构变异，以及进一步评估预测变异和识别与基因型相关的突变。 inGAP 系列是用 Java 实现的，以提供一个独立于平台的工具，并支持命令行模式和图形模式。 输出也可以在用户友好的图形界面中可视化，以检查 SNP、插入缺失和大规模结构变体。