matlab代码影响-MesoscopicModel:介观模型

时间:2021-05-22 09:32:55
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文件名称:matlab代码影响-MesoscopicModel:介观模型
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更新时间:2021-05-22 09:32:55
系统开源 matlab代码影响介观模型1.0 一种离散的,随机的,网格上的,多隔间的,中尺度和3D计算仿真工具,用于研究肿瘤生长过程中的进化动力学和异质性 1.说明 在这里,我们提出了介观模型,一个旨在在计算机上重现肿瘤生长和进展的模拟平台,以便可以研究进化动力学和肿瘤内异质性并与其他宏观肿瘤特征相关。 该模型在介观范围内起作用,整合了细胞水平的信息和与临床相关的大型肿瘤。 这样,可以在相当快的时间内(2〜5分钟)对直径近6厘米,最多10 10个细胞的整个模拟肿瘤进行模拟。 该模型使我们能够实现突变和CNV信息,这些信息会影响细胞的行为方式和彼此相互作用,同时保持与临床图像相同的分辨率,因此可以将真实的PET和/或MRI图像与模型结果进行比较。 下图显示了这样的一个示例:在A)中,我们可以看到真实胶质母细胞瘤的MRI图像,而在B)中,描绘了几个计算机肿瘤切片(来自模拟参数,适用于真实胶质母细胞瘤的参数)。 值得注意的是,真实胶质母细胞瘤中出现的小叶被模型复制,出现在模拟肿瘤中。 该模型基于网格3D空间域,其中每个隔间可以包含几个单元。 隔室称为体素,因为它们保持与该基本临床成像单元相同的分辨率(
【文件预览】:
MesoscopicModel-main
----fig5.png(3.76MB)
----Core modules()
--------grid.jl(15KB)
--------Param_dist.txt(30B)
--------monitor.jl(9KB)
--------constants.jl(8KB)
--------tools.jl(3KB)
--------main.jl(4KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(36KB)
----fig4.png(1.03MB)
----Matlab graphics()
--------dcode_simfiles.m(3KB)
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----fig1.png(1.14MB)

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