文件名称：生物信息学算法
文件大小：38KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-13 00:55:55
Python
欢迎！ 该存储库包含我在Phillip Compeau和Pavel Pevzner撰写的《生物信息学算法：一种主动方法》中算法的许多实现。 已针对rosalind.info（与文本相对应的网站）上的数据集测试了该存储库中的每个文件。
【文件预览】：
Bioinformatics-Algorithms-master
----Chapter 5()
--------editdistance.py(8KB)
--------manhattan.py(366B)
----README.md(553B)
----Chapter 2()
--------motifs.py(172B)
--------randomizedMotifSearch.py(1024B)
--------numToPattern.py(509B)
--------hamming.py(144B)
--------medianString.py(537B)
--------profileMatrix.py(159B)
--------pseudoCountMatrix.py(459B)
--------patToNumber.py(426B)
--------letterMap.py(188B)
--------score.py(527B)
--------random.py(180B)
--------d.py(229B)
--------countMatrix.py(496B)
--------minD.py(411B)
--------greedyMotifSearch.py(969B)
--------profileMostProb.py(490B)
----Chapter 6()
--------breakpoints.py(28KB)
--------cycleToChrom.py(1012B)
--------chromToCycle.py(834B)
----Chapter 1()
--------motifEnumeration.py(926B)
--------patternClump.py(10KB)
--------approxPatMatchRev.py(349B)
--------mostFrequent.py(1KB)
--------findFreqWMisMatch.py(1KB)
--------count.py(195B)
--------approxPatMatch.py(259B)
--------approxOccurence.py(216B)
--------hamming.py(144B)
--------findFreqMismatchClose.py(1KB)
--------mostFrequentSort.py(2KB)
--------reverseComplement.py(331B)
--------skew.py(660B)
--------dNeighborhood.py(791B)
--------freqWordsWMismatchRev.py(2KB)
--------patternMatch.py(169B)
----Chapter 3()
--------prefixSuffix.py(141B)
--------overlap.py(714B)
--------composition.py(467B)
--------debruijnKmers.py(722B)
--------debruijn.py(3KB)
--------genomePathRecon.py(440B)