文件名称：CLIIQ:表达同种型的准确比较检测和定量-开源
文件大小：55KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-17 22:32:43
开源软件
CLIIQ 是一种计算方法，用于同时识别和量化来自群体中多个样本的表达同种型。 鉴于 RNA-seq 映射结果和基因注释，CLIIQ 通过解决 ILP（整数线性规划）问题报告样本中表达的同种型列表。 在维基页面返回之前，请查看 http://www.sfu.ca/~yenyil/cliiq.html 以获取安装和执行 CLIIQ 的说明。
【文件预览】：
cliiq-0.1.0.2
----GenerateCPLEX.cpp(130KB)
----GeneAnnotation.cpp(21KB)
----ReadToGene.h(3KB)
----ReadToGene.cpp(14KB)
----GeneAnnotation.h(4KB)
----RunCPLEX.h(2KB)
----CommandLineParser.cpp(6KB)
----GenerateCPLEX.h(11KB)
----AnalyzeCPLEX.h(6KB)
----CommandLineParser.h(2KB)
----Common.h(3KB)
----Makefile(1KB)
----AnalyzeCPLEX.cpp(45KB)
----RunCPLEX.cpp(6KB)
----cliiq.cpp(3KB)
----AnalyzeIsoform.cpp(122KB)
----AnalyzeIsoform.h(11KB)
----Common.cpp(6KB)