文件名称：intercode
文件大小：724KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-20 19:04:20
JupyterNotebook
Intercode-可解释的自动编码器 Intercode是一个包，用于学习单单元格数据的可解释潜在表示。 Intercode包含自动编码器的实现，该实现可强制潜在维度对应于预定义的基因集。 使用与安装 Intercode需要pytorch，numpy和andata。 用pip安装 pip install intercode 有关示例，请参见。 阅读以获取描述。
【文件预览】：
intercode-main
----README.rst(653B)
----intercode()
--------utils.py(3KB)
--------linear_decoder.py(7KB)
--------__init__.py(234B)
--------model.py(8KB)
----LICENSE(1KB)
----requirements.txt(33B)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(2KB)
----notebooks()
--------example-Kang18.ipynb(237KB)
--------c2.cp.reactome.v4.0.symbols.gmt(323KB)
--------REACTOME_license.txt(665B)
--------example-Macosko15.ipynb(104KB)
--------astrocytes.csv(988B)
--------intercode-api-Kang18.ipynb(541KB)