文件名称:AC-DIAMOND-开源
文件大小:712KB
文件格式:GZ
更新时间:2024-06-15 14:55:38
开源软件
迄今为止,要加快与蛋白质数据库的DNA读码或组装的重叠群的比对一直是一个挑战。 最近的工具DIAMOND以相似的灵敏度显着提高了BLASTX和RAPSearch的速度。 但是对于像宏基因组学这样涉及大量数据的应用程序,DIAMOND仍然花费太多时间。 我们介绍了AC-DIAMOND,它试图通过更好的SIMD并行化和参考索引来加快DIAMOND的速度。 实验结果表明,在对齐DNA读数或重叠群时,AC-DIAMOND比DIAMOND快4倍,同时保持基本相同的灵敏度。
【文件预览】:
ac-diamond-0.1-beta-linux64
----README.rst(5KB)
----ac-diamond(2.29MB)