restring:功能丰富术语聚合器

时间:2024-04-19 13:30:29
【文件属性】:

文件名称:restring:功能丰富术语聚合器

文件大小:5.02MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-19 13:30:29

Python

重新串 易于使用的功能性富集术语检索器和聚集器,专为湿生物学研究人员设计 概述 restring处理用户提供的差异表达(DE)基因列表,并自动从提取和汇总功能性富集数据。 它以表格友好的格式返回来自多个比较分析的汇总结果。 通过高度可定制的热量/群集图可以轻松看到结果,以制作精美的出版物级照片。 另外,它还有一个GUI! 在哪些比较中发现了哪种KEGG途径? 什么是pvalues? 在这些比较*享了在该途径中注释的哪些DE基因? 如何同时显示所有实验组所有术语的结果? 所有这些都可以通过restring来管理。 用例 现代的高通量组学方法会产生大量差异表达(DE)基因/蛋白质,进而可用于功能富集研究。 手动检查大量此类分析非常耗时,特别是对于具有多个组的实验设计。 让我们考虑以下实验设置: 这代表了相当普遍的实验设计,但是对于所有可能的组合,手动检查功能富集结果将需要大量的精力。


网友评论