文件名称：Rustyread 是 badread 模拟的替代品。
文件大小：2.79MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-18 12:58:29
bioinformatics long-reads
Rustyread 是badread simulate替代品。Rustyread 深受badread 的启发，它重用了相同的错误和质量模型文件。但是 Rustyreads 是多线程的，并且受益于其他优化。用法安装最低支持的 Rust 版本与badread的区别警告：Rustyread 尚未经过评估，甚至还没有与任何其他长读生成器进行比较Rustyread 仅在 Linux 上测试Rustyread 仍在开发中，很多东西可以改变或被破坏用法如果之前您像这样调用 badread：badread simulate --reference {reference path} --quantity {quantity} > {reads}.fastq你现在可以用 rustyread 替换 badread：rustyread simulate --reference {reference path} --quantity {quantity} > {reads}.fastq但是默认情况下 rustyread 使用所有可用的核心，您可以使用选项threads控制它：rustyread --theads
【文件预览】：
rustyread-master
----.gitignore(490B)
----images()
--------logo.svg(13KB)
----benches()
--------add_error.rs(1KB)
----src()
--------references.rs(10KB)
--------alignment.rs(2KB)
--------model()
--------bin()
--------cli()
--------simulate()
--------error()
--------lib.rs(3KB)
----LICENSE(1KB)
----Cargo.toml(1KB)
----.github()
--------workflows()
----Readme.md(6KB)
----tests()
--------data()
--------no_parameter.rs(146B)
--------common()
--------two_run_same.rs(1KB)
----comparison()
--------.gitignore(55B)
--------Snakefile(154B)
--------etc()
--------scripts()
--------notebook.ipynb(22.28MB)
--------envs()
--------rules()