single-cell

时间:2024-04-06 23:55:53
【文件属性】:

文件名称:single-cell

文件大小:3KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-06 23:55:53

单细胞 WormBase如何处理单细胞RNA数据:scvi-tools 目前,有数百种针对scRNAseq数据开发的软件工具和管道(请参阅: ://www.scrna-tools.org)。为了在WormBase处理单个销售数据,我们选择使用框架。 scvi-tools与大多数其他scRNAseq工具的不同之处在于,它使用来学习输入数据的基础分布并创建生成模型。有兴趣的读者可以在scvi-tools中了解有关该框架的更多。在这里,我们简要强调一些考虑因素,这些因素导致我们选择使用框架来驱动scRNAseq分析。 可扩展性:使用GPU,scvi工具可以扩展到具有数百万个单元的数据集。这些大型模型可以在大约一个小时内进行训练。 一致的开发和贡献者:scvi-tools代码库于2017年首次引入,并由于2018年发布。目前,它拥有独特的贡献者和发行版本。 可扩展的分析框架:由于可以修改数据的


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single-cell-main
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