文件名称：RAPSearch2:基于简化字母的蛋白质相似性搜索-开源
文件大小：3.39MB
文件格式：GZ
更新时间：2024-07-17 01:21:57
开源软件
RAPSearch2 是一种用于快速蛋白质相似性搜索的工具。 RAPSearch2 在蛋白质数据库中搜索短 DNA 序列（读取）或蛋白质序列，与 BLASTX（读取约 100bp）相比实现了 >100 倍的加速，或在加速模式下比 BLASTX 的加速超过 1000 倍（选项“-a”） . RAPSearch2 利用减少的氨基酸字母表和灵活的种子，因此可以通过散列快速识别各种长度的不匹配种子。