文件名称：pophistory-tutorial:有关使用流行工具来了解人口历史的教程
文件大小：5.18MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-20 12:04:39
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从遗传学推论历史的教程 乔·皮克雷尔 介绍 本教程的目的是向您介绍一些重要的工具，用于从遗传学中学习历史。 对这些问题感兴趣的人的标准设置是在感兴趣的人群中对成千上万的SNP进行基因分型，然后问：该人群的历史是什么？ 您将在本教程中运行的工具提供有关此问题的信息摘要。 但是，请注意，没有“黑匣子”解决方案-所有方法都可能产生误导，主要的困难不是运行软件，而是解释结果。 本教程中有两个示例数据集，均来自人群遗传学（第一个示例中的数据来自，第二个示例中的数据来自）。 第一个示例旨在说明即使简单的分析也可以具有复杂的解释，第二个示例旨在让您了解一些有关人口历史的主要分析工具。 初赛 我们假设您可以从命令行轻松进行并已安装： smartpca（在） （包括threepop和fourpop） （我们将假设您具有GUI） 例子1 本教程中有两个目录， example1/和example2/
【文件预览】：
pophistory-tutorial-master
----example2()
--------example2.ind(2KB)
--------example2.eigenstratgeno(16.76MB)
--------par.example2(243B)
--------example2.strct_in(930KB)
--------example2.treemix.gz(1.04MB)
--------plotting_funcs.R(16KB)
--------example2.snp(6.77MB)
--------pop_order(21B)
----README.md(10KB)
----example1()
--------example1.treemix_in.gz(649KB)