造血学家

时间:2024-03-10 11:51:53
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文件名称:造血学家

文件大小:681KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-10 11:51:53

Python

皮肤科医生 Gromologist是一个软件包,旨在简化对GROMACS拓扑文件(.top和.itp)以及兼容结构(.pdb和.gro)的处理,编辑和操作。 安装 可以通过键入pip install gromologist直接通过pip获得最新的“官方”发行版。 要获取最新的开发版本,请先在本地克隆git repo( git clone https://gitlab.com/KomBioMol/gromologist.git ),然后通过输入pip install .将软件包安装到Python中pip install . 在Gromologist主目录中。 如果您使用的是Anaconda,则/path/to/anaconda/bin/pip 。 用法 读写文件 Top和Pdb是库的核心类,应该分别提供拓扑和结构对象的表示形式。 要初始化它们,应将文件的路径传递给构造函数: >>> fr


【文件预览】:
gromologist-master
----setup.py(321B)
----.gitignore(39B)
----prova(0B)
----LICENSE(34KB)
----examples()
--------01_pentapeptide()
--------README.md(33B)
----README.md(12KB)
----tests()
--------tmp.txt(0B)
----gromologist()
--------Topology.py(16KB)
--------Subsection.py(29KB)
--------Pdb.py(35KB)
--------__init__.py(465B)
--------Parser.py(6KB)
--------Mutant.py(12KB)
--------DihOpt.py(26KB)
--------Section.py(60KB)
--------Entries.py(17KB)
----test.top(2.22MB)
----docs()
--------tmp.txt(0B)

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