文件名称：parallel_hmmer:让 HMMER 程序使用数据库预拆分来计算节点。-开源
文件大小：93KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-20 03:41:58
开源软件
修改后的 HMMER 可以利用跨计算节点拆分的数据库，而不是在主节点上使用一个大型数据库并在每次运行时跨网络移动所有数据。 还实现了一个知道这些变化的网络服务器接口。
【文件预览】：
parallel_hmmer-1.0.1
----parallel_h3dblist.txt(659B)
----fastarange.c(7KB)
----SAF_patches.txt.v2(123KB)
----README.TXT(10KB)
----hmmercontrol_rev3.pl(242KB)
----many_hmmscan_1cpu.sh(5KB)
----parallel_dblist.txt(8KB)
----secondary_storage(3KB)
----from_secondary(2KB)
----split_pfam3db_rev2.sh(948B)
----mailresults.sh(436B)
----secondary.txt(1KB)
----machines.relspeed.hmmer3_rev2(310B)
----HOW_TO_DO_PFAM.TXT(3KB)
----splitpfam3db_rev2.pl(6KB)
----genericfailurehtml.pl(1KB)
----fastaproperties.c(10KB)
----pfamsplitnlist.c(9KB)
----mailresults.pl(12KB)
----HOW_TO_DO_SECONDARY_STORAGE.TXT(2KB)
----setuser.c(3KB)