【文件属性】：
文件名称：matlab说话代码-btmorphmirror:SWC文件表示为图形
文件大小：3.86MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-22 09:44:22
系统开源
matlab说话代码btmorph
介绍
小型Python库，其中包含数据结构和工具，用于表示和分析以事实上的标准SWC格式存储的神经元形态。
见下文。
安装
先决条件
您将需要Python（2.7），/和运行代码。
强烈建议您使用它，因为它为Python提供了一个交互式环境（如Matlab）。
Linux：大多数Linux发行版的软件包管理器中都包含这些软件包的版本，可以轻松安装。
Windows和Mac：上述所有软件包均随附有“科学python”软件包。
最著名的来自或。
或者，检查Ipython。
正确安装
笔记
以下说明适用于Linux和Max
OSX系统，并且仅使用命令行工具。
请遵循Windows系统或带有图形界面的工具的相应手册。
检出git仓库并调整$PYTHONPATH
。
git
clone
https://bitbucket.org/btorb/btmorph.git
cd
btmorph
export
PYTHONPATH=$(pwd):$PYTHONPATH
上面的命令将临时设置您的$PYTHONPATH
。
在您的.bashrc添加适当的路径，以使该软件包永
【文件预览】：
btmorphmirror-master
----readme.rst(7KB)
----examples()
--------data()
--------.gitignore(11B)
----docs()
--------figures()
--------readme.rst(7KB)
--------conf.py(11KB)
--------requirements.txt(44B)
--------clean.sh(29B)
--------index.rst(481B)
--------validation.rst(6KB)
--------visualization.rst(6KB)
--------.gitignore(35B)
--------api.rst(954B)
--------tutorial.rst(9KB)
----tests()
--------moto_1_outputted.swc(18KB)
--------soma_only.swc(95B)
--------structs_test.py(2KB)
--------test_fraclac_1024.bmp(3MB)
--------testimage_fracla_256_3.bmp(192KB)
--------horton-strahler_test_wiki.swc(639B)
--------grids_test.py(27KB)
--------testimage_fracla_256.bmp(192KB)
--------line_test.bmp(192KB)
--------hs_2.swc(95B)
--------soma_types()
--------v_e_moto1.CNG.swc(17KB)
--------test()
--------horton-strahler_test_wiki_3pointsoma.swc(682B)
--------stats_test.py(11KB)
--------testimage_fracla_256_1.bmp(192KB)
--------testimage_fracla_256_4.bmp(192KB)
--------testimage_fracla_256_2.bmp(192KB)
--------.gitignore(31B)
--------slicing_by_size.py(2KB)
--------example.py(638B)
--------my_soma_only.swc(95B)
----.gitignore(35B)
----btmorph()
--------config.py(245B)
--------btviz_dynamic.py(5KB)
--------btstats.py(38KB)
--------population_density_plots.py(11KB)
--------__init__.py(725B)
--------btviz.py(25KB)
--------tools()
--------grids.py(17KB)
--------btstructs2.py(35KB)
--------box_counting.py(6KB)