ASpli：当前BioC ASpli版本的公共回购

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文件名称：ASpli：当前BioC ASpli版本的公共回购
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更新时间：2021-02-25 06:02:07
R 阿斯普利 集成的R​​程序包，用于使用RNAseq分析替代剪接 作者 Estefania Mancini，AndrésRabinovich，Javier Iserte，Marcelo Yanovsky，Ariel Chernomoretz 介绍 选择性剪接（AS）是真核生物中转录后基因调控的一种常见机制，它通过产生编码结构和功能上不同的蛋白质的多个mRNA同工型，扩展了单个基因的功能和调控多样性。 自NGS（下一代测序）技术问世以来，对AS的全基因组分析一直是非常活跃的研究领域。 从那时起，不断增长的数据可用性和日益复杂的分析方法的发展就揭示了通用拼接库的复杂性。 ASpli专门设计为集成几个独立的信号，以应对拼接模式中可能出现的复杂性。 考虑到基因组注释信息， ASpli考虑基于bin的信号以及交界包含索引，以评估读取覆盖率的统计显着变化。 此外，基于完整的实验检测的拼接点集合，估计