bowtie a Next generation sequence alignment software for windows

时间:2014-02-03 08:44:23
【文件属性】:

文件名称:bowtie a Next generation sequence alignment software for windows

文件大小:12.01MB

文件格式:ZIP

更新时间:2014-02-03 08:44:23

bowtie NGS software

用于下一代测序的sequence alignment 软件,在windows上运行


【文件预览】:
bowtie-0.12.7
----bowtie-build.exe(1.25MB)
----MANUAL.markdown(81KB)
----pthreadGC2.dll(59KB)
----genomes()
--------NC_008253.fna(4.84MB)
----bowtie-inspect-debug.exe(2.43MB)
----VERSION(6B)
----AUTHORS(722B)
----doc()
--------README(154B)
--------style.css(4KB)
--------manual.html(120KB)
----bowtie-debug.exe(8.71MB)
----bowtie.exe(1.72MB)
----bowtie-inspect.exe(1.15MB)
----reads()
--------e_coli_10000snp.fa(438KB)
--------e_coli_1000.fa(43KB)
--------e_coli_1000_2.fa(42KB)
--------e_coli_1000_1.fa(45KB)
--------e_coli_1000.raw(36KB)
--------e_coli_10000snp.fq(829KB)
--------e_coli_1000.fq(82KB)
--------e_coli_1000_1.fq(84KB)
--------e_coli_1000_2.fq(78KB)
----indexes()
--------e_coli.rev.1.ebwt(1.41MB)
--------e_coli.4.ebwt(1.18MB)
--------e_coli.3.ebwt(17B)
--------e_coli.rev.2.ebwt(603KB)
--------e_coli.1.ebwt(1.41MB)
--------e_coli.README(281B)
--------e_coli.2.ebwt(603KB)
----NEWS(30KB)
----bowtie-build-debug.exe(3.47MB)
----MANUAL(69KB)
----scripts()
--------make_mm9.sh(2KB)
--------convert_quals.pl(3KB)
--------make_h_sapiens_ncbi36.sh(2KB)
--------make_h_sapiens_ncbi37.sh(2KB)
--------reconcile_alignments.pl(10KB)
--------make_e_coli.sh(1KB)
--------reconcile_alignments_pe.pl(16KB)
--------build_test.sh(278B)
--------pe_verify.pl(11KB)
--------best_verify.pl(5KB)
--------gen_solqual_lookup.pl(1KB)
--------make_b_taurus_UMD3.sh(2KB)
--------make_mm8.sh(2KB)
--------gen_dnamasks2colormask.pl(834B)
--------make_canFam2.sh(1KB)
--------random_bowtie_tests.sh(1KB)
--------make_c_elegans_ws200.sh(1KB)
--------colorize_fastq.pl(1KB)
--------make_hg18.sh(2KB)
--------make_rn4.sh(2KB)
--------make_galGal3.sh(2KB)
--------make_d_melanogaster_fb5_22.sh(1KB)
--------random_bowtie_tests_p.sh(688B)
--------gen_2b_occ_lookup.pl(2KB)
--------gen_occ_lookup.pl(6KB)
--------make_hg19.sh(3KB)
--------make_a_thaliana_tair.sh(1KB)
--------make_m_musculus_ncbi37.sh(2KB)
--------random_bowtie_tests.pl(35KB)
--------colorize_fasta.pl(1KB)
--------make_s_cerevisiae.sh(1KB)
--------mapability.pl(5KB)
--------bs_mapability.pl(7KB)
--------fastq_to_tabbed.pl(3KB)
----COPYING(5KB)
----TUTORIAL(6KB)

网友评论

  • 本人愚钝,不会用这个软件。。。。
  • 是对的,但是想把它好好装上需要好好研究,建议有人指导~~~~