文件名称：long_range_LD:使用TAPER算法查找远距离LD
文件大小：81KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-08 09:06:52
C++
long_range_LD 使用TAPER算法对远程LD进行存储。 这是一个实验性程序，可使用TAPER算法找到远距离LD（ ）。 简而言之，该程序使用相关系数的上限来忽略可能不具有高于给定阈值的相关系数的成对SNP比较。 实际上，除非将阈值设置得很高，否则成对比较的数量仍然太大，以致于无法认真使用此程序。 另外，成对相关系数的使用对于寻找跨染色体的长距离LD可能是不合适的。
【文件预览】：
long_range_LD-master
----long_range_LD.xcodeproj()
--------project.xcworkspace()
--------project.pbxproj(18KB)
--------xcuserdata()
----long_range_LD()
--------bgzf.h(6KB)
--------bcf_entry.cpp(17KB)
--------bgzf.c(21KB)
--------khash.h(18KB)
--------bcf_entry_setters.cpp(9KB)
--------parameters.cpp(23KB)
--------entry_filters.cpp(28KB)
--------output_log.cpp(2KB)
--------knetfile.h(2KB)
--------parameters.h(3KB)
--------bcf_file.cpp(4KB)
--------vcf_entry.cpp(17KB)
--------entry.cpp(21KB)
--------entry.h(9KB)
--------header.cpp(13KB)
--------output_log.h(936B)
--------vcf_entry_setters.cpp(5KB)
--------main.cpp(10KB)
--------vcf_file.h(777B)
--------entry_getters.cpp(11KB)
--------variant_file.cpp(6KB)
--------variant_file_filters.cpp(4KB)
--------main.h(520B)
--------knetfile.c(18KB)
--------vcf_entry.h(2KB)
--------vcf_file.cpp(4KB)
--------entry_setters.cpp(660B)
--------header.h(2KB)
--------bcf_file.h(696B)
--------variant_file.h(2KB)
--------bcf_entry.h(3KB)
----README.md(694B)