文件名称：皮普
文件大小：67KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-14 02:53:49
Python
来自10x Genomics单细胞RNA-Seq实验的蛇形制作管线，用于识别基因组中的极端读取堆积位点。 安装 步骤1：安装miniconda3（）。 对于MacOS： $ sh Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh 步骤2：安装snakemake $ conda install -c conda-forge -c bioconda snakemake=5.11.2 检查蛇形安装成功 $ which snakemake && snakemake --version 如果您在路径中没有看到snakemake，则可以关闭并重新打开终端以激活效果，然后再次检查。 步骤3：下载并运行 $ git clone https://github.com/yh154/Pyup.git $ cd Pyup $ snakemake --cores 1 --use-co
【文件预览】：
Pyup-master
----workflow.png(61KB)
----README.rst(2KB)
----envs()
--------samtools.yaml(77B)
--------script.yaml(74B)
--------umitools.yaml(80B)
--------bamtools.yaml(79B)
----scripts()
--------Pyup.py(11KB)
----config.yaml(278B)
----Snakefile(3KB)
----Singularity(658B)