自洽聚类法识别大肠杆菌SD序列* (2008年)

时间:2021-06-19 05:07:27
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文件名称:自洽聚类法识别大肠杆菌SD序列* (2008年)
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更新时间:2021-06-19 05:07:27
自然科学 论文 用自洽聚类方法判定大肠杆菌蛋白质编码基因SD序列强弱,给出构成强SD序列的17种碱基关联模式。将全部SD序列按作用强弱不同分为三类:强、中、弱,发现强弱不同时最偏好模式不同,如GGAGG是弱SD序列的最偏好模式,AAGGA是强SD序列的最偏好模式。同一模式距起始密码子的距离不同时,所起的调控作用也不同,如GGAG模式中的A在强SD序列中位于-8位点,在弱SD序列中位于-7和-9位点。平均来说,各SD序列的-9位点上碱基G出现的概率最大。结果还表明SD序列越强,基因的表达水平越高,SD序列越弱,基因表达水平

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