文件名称：matlab余玄函数代码-ConMod:识别多个生物网络中的保守功能模块
文件大小：25KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 16:21:39
系统开源
matlab余玄函数代码康莫德 该算法用于识别多个网络中的保守功能模块，如以下所述： 特征相关的多视图非负矩阵分解，用于识别多个生物网络中的保守功能模块。 王佩卓，高林，胡玉轩和李峰。 BMC生物信息学，2018，19（1）：394。 该算法主要在Matlab 2015b中实现。 用法 输入格式 该代码将一系列网络作为输入。 这些网络必须存储在matlab中类型为cell的变量中。 每个网络可以由以下两种类型表示： 邻接矩阵 边缘列表，例如： 1 2 0.62 1 3 0.88 2 9 0.14 ... 这些代码用于生成综合数据集： syn_dataset_common.m ：保守的模块具有相同的大小，并且对于一组给定的网络是通用的。 syn_dataset_overlap.m ：保守的模块仅存在于一部分网络中，它们是跨不同网络的特定模块的重叠部分。 主要功能 ConMod.m ：ConMod算法的实现。 function modulesfinal = ConMod(multiNetworks, N, K, lambda, xita, maxIter) % INPUT: % multi
【文件预览】：
ConMod-master
----ConMod.m(1KB)
----setSimilarity.m(405B)
----evaluation.m(2KB)
----moduleNodesSelection.m(2KB)
----syn_dataset_overlap.m(3KB)
----multiViewNMF.m(3KB)
----main_run.m(2KB)
----SNMF.m(1016B)
----featureNets.m(3KB)
----significantModules.m(5KB)
----LICENSE(34KB)
----syn_dataset_common.m(3KB)
----README.md(3KB)
----SNMFforView.m(1KB)
----.gitattributes(66B)