文件名称:Pipebar:用于 DNA 条形码分析的快速准确的管道。-开源
文件大小:14KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-18 18:03:08
开源软件
分子分析需要使用多种生物信息学工具。 在这里,我们提出了一个通过开源工具集成对 Sanger 平台进行 DNA 色谱分析的管道,以通过标准商业许可降低成本,确保高质量、稳健性和减少时间。 Pipebar 是一个 Python 应用程序,用于将色谱图跟踪文件自动处理为高质量 DNA 序列以进行下游分析。
【文件预览】:
trimfastq
fastq_to_fasta.py
viewQual.py
abi2fastq
pipebar
fastqCombinePairedEnd-Mod.py
trimmStopCodon.py
filterfastq
overlapper.py