向HelmCoP数据库直系同源组添加古菌序列 (2014年)

时间:2024-06-03 21:27:01
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文件名称:向HelmCoP数据库直系同源组添加古菌序列 (2014年)

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更新时间:2024-06-03 21:27:01

自然科学 论文

含有古菌序列的直系同源组可以在很大程度上便利各种基于HelmCoP数据的研究,但是目前HelmCoP直系同源组不含有任何古菌序列.为了向HelmCoP直系同源组添加古菌序列,以1个OrthoMCL-DB网站工具的分配方法为依据,我们将29种古菌物种模式菌株的蛋白质组数据,通过BLAST比对和OrthoMCL分析,逐步添加至各个HelmCoP直系同源组中.结果显示,21 326条古菌序列被成功地分配给了1 954个HelmCoP直系同源组中,而其他2 821条古菌序列被归类至NO_GROUP类别.这些分配结


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