文件名称:PREEMACS:PREEMACS。 猕猴脑表面预处理和提取的管道
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更新时间:2024-06-07 02:41:41
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PREEMACS 管道用于MAC aque脑小号urface的PRE的处理和E xtraction PREEMACS是一组工具,这些工具取自通常用于人类数据分析的多种图像处理软件,这些软件针对恒河猴的大脑表面提取和皮层厚度分析进行了定制。 安装 为了易于安装,请查看Wiki 模块1 执行体积定向,图像裁剪,强度非均匀性校正和体积平均,最后通过卷积神经网络进行颅骨剥离(PREEMASK脑罩工具) 。 模块2 使用MRIqc方法的适应性进行质量控制,以提取质量度量,然后将其用于确定准确的脑表面估计的可能性。 模块3 该模块使用NHP定制版本的FreeSurfer v6从T1加权体积(T1w)估计白质和部分表面。 PREEMACS NHP模板 为了将FreeSurfer定制为NHP,基于PRIME-DE的29个主题(M*等,2018)和UNAM-INB数据集中的4个主题,开发了