ukb_download_and_prep_template:在使用UK Biobank数据时,该存储库可简化常见数据预处理步骤

时间:2024-04-16 12:47:58
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文件名称:ukb_download_and_prep_template:在使用UK Biobank数据时,该存储库可简化常见数据预处理步骤

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更新时间:2024-04-16 12:47:58

Python

ukb_download_and_prep_template 详细文档可。 重要说明:如果您使用或正在使用此回购的19.02.2021之前的版本,则日期处理中的错误可能导致错误分配了健康结果日期。 请重新下载并重新处理用addNewHES.py处理的所有数据。 这是开发中的版本,可能会进行重大更改和更正-使用后果自负! 请直接在GitHub页面上或通过发送电子邮件至分享发现的评论,建议和错误/错误。 快速开始 本用法教程假定您已从UK hesin_all.csv下载并提取了包含参与者数据的.csv文件和包含健康记录数据的hesin_all.csv文件。 文件夹包含有关如何下载这些文件的指南。 1.安装 要使用此仓库,请运行: $ git clone git@github.com:activityMonitoring/ukb_download_and_prep_template 此


【文件预览】:
ukb_download_and_prep_template-main
----icdGroups.json(8KB)
----derivedColumns.json(681B)
----.github()
--------workflows()
----writeColumnsFile.py(1KB)
----download()
--------download_health_data()
--------helpers()
--------README.md(254B)
--------download_participant_data()
----analysisCols.txt(7KB)
----Data_Dictionary_Showcase.csv(3.22MB)
----LICENSE(1KB)
----test()
--------derivedColumns.json(125B)
--------analysisCols.txt(200B)
--------test_ref.csv(317B)
--------columnsTestReplacement.json(385B)
--------test.csv(200B)
----README.md(3KB)
----filterUKB.py(6KB)
----Codings_Showcase.csv(3.92MB)
----docs()
--------make.bat(760B)
--------conf.py(2KB)
--------download.rst(5KB)
--------advanced.rst(7KB)
--------core.rst(5KB)
--------index.rst(494B)
--------Makefile(634B)
--------started.rst(2KB)
----.gitignore(175B)
----icdGroupsCVDParticular.json(11KB)
----addNewHES.py(4KB)

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