matlab代码影响-RNASeq:(sc)RNASeq资源

时间:2024-06-11 04:08:09
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更新时间:2024-06-11 04:08:09

系统开源

matlab代码影响(sc)RNASeq资源的一般列表 劳拉·格里斯(Laura Grice) scRNASeq 101 是此列表的更全面版本,列出了软件包,Web门户/数据库,重要期刊文章,研究人员... 明堂的清单和 数据库-“分析单细胞RNA测序数据的工具目录” Ming Tang是哈佛大学的生物信息学家。 他经常在上讨论scRNASeq。 他也有一个 麻省理工学院(powerpoint PDF)的广泛著作,通过scRNASeq技术,实验设计,分析管道,伪时间介绍了该理论(带有一些代码)。 大部分是付费的,但是第1章(什么是单细胞RNASeq)是免费的 明堂很有用。 本教程的大部分内容涵盖了基本的Seurat小插图,但其中也包括有用的链接,说明和不同情节的“ DIY版本”。 基本scRNASeq分析的分步工作流程 博德学院已经发表了一本书的大量笔记。 尤其值得关注的是讨论Seurat的[第9.4节](())。 或在 电子书:。 主要集中在使用SingleCellExperiment对象。 它包含教程/代码,还包含各种分析背后的思想。 这本书以形式出现。 -集成单细胞分析。 “在这


【文件预览】:
RNASeq-master
----scRNASeq_101()
--------cellranger101.md(6KB)
--------batcheffects.md(7KB)
--------scRNASequencing101.md(3KB)
--------seurat101.md(38KB)
--------imputation.md(7KB)
----README.md(44KB)

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