肯尼亚卢旺达合作

时间:2024-02-29 20:34:21
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文件名称:肯尼亚卢旺达合作

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更新时间:2024-02-29 20:34:21

项目工作计划 这是肯尼亚和卢旺达合作开展COVID-19项目的资源库。 我们将执行以下操作: 样本下载 样本注释 个别国家分析 使用肌肉对准器进行Squent对准: : Aliview程序: ://ormbunkar.se/aliview/ 我们将使用BEAST分析,从中我们获得估计的替代率 BEAST软件-贝叶斯进化分析采样: : 结果 系统发育树的可视化效果: 卢旺达样品 分类群的进化关系 进化史是用邻居加入法[1]推论的。 从1000个重复中推断出的引导共识树[2]被用来代表所分析的分类单元的进化历史[2]。 与少于50%的引导程序复制中复制的分区对应的分支被折叠。 进化距离是使用最大复合可能性法计算的[3],单位是每个位点的碱基取代数。 该分析涉及37个核苷酸序列。 所包括的密码子位置为第一+第二+第三。 对于每个序列对,删除所有歧义位置(成对删除选项)。


【文件预览】:
KenyaRwandaCollaboration-main
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--------Maximum Likelihood Estimate of Substitution Matrix.docx(14KB)
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