psicalc-package:PyPi软件包,其中包含用于运行psicalc的算法

时间:2024-03-18 03:53:37
【文件属性】:

文件名称:psicalc-package:PyPi软件包,其中包含用于运行psicalc的算法

文件大小:20KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-18 03:53:37

Python

PSICalc算法包 这是一个利用归一化的互信息来聚类蛋白质序列的聚类多序列比对(MSA)的程序包。 此处提供了适用于psicalc的完整数据可视化工具: : 。 举个例子: import psicalc as pc file = "" # e.g "PF02517_seed.txt" data = pc.read_txt_file_format(file) # read Fasta file data = pc.durston_schema(data, 1) # Label column index starting at 1 result = pc.find_clusters(7, data) # will sample every 7th column pc.write_output_data(7, result) 该程序将运行并返回具有在提


【文件预览】:
psicalc-package-main
----README.md(698B)
----psicalc()
--------__pycache__()
--------__init__.py(23B)
--------psicalc.py(14KB)
----setup.py(909B)

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