ggd-recipes:GGD的食谱

时间:2024-07-22 20:53:07
【文件属性】:

文件名称:ggd-recipes:GGD的食谱

文件大小:8KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-22 20:53:07

GGD食谱 工作正在进行中。 害怕。 而且很关键。 这个存储库包含 YAML 配方,定义了如何查找和转换基因组数据集,这些数据集将由非常新生且令人难以置信的 alpha 工具集安装。 GGD 力求成为一个原型,用于演示如何通过单个工具下载和安装位于不同网站和存储库上的基因组注释和数据集。 这个存储库包含一个“食谱”的“食谱”,试图做到这一点。 它非常不完整,在这一点上是一个玩具。 食谱遵循本体论。 例如,可以使用 GGD 从 UCSC for Human build 38 安装 CpG 岛。命令是: # source.species.genomebuild.name python ggd.py install ucsc.human.b38.cpg 在这种情况下,配方将位于此存储库中: ucsc/human/b38/cpg.yaml 下面是基于 RepeatMasker 轨迹从


【文件预览】:
ggd-recipes-master
----README.md(2KB)
----ncbi()
--------human()
----ucsc()
--------human()
----ensembl()
--------human()
----misc()
--------human()

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