文件名称：msms_structure_annot
文件大小：582KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-07 15:12:50
JupyterNotebook
MS / MS假设结构注释 概述 该软件包允许您使用MS / MS谱图为修饰肽具有未知修饰模式的结构提出结构建议。它还允许您使用这些假设结构来注释修饰肽的MS / MS谱图。该程序包生成多个可能的假设结构，对它们进行计算片段化，然后将这些假设片段与MS / MS数据中观察到的离子对齐，以对肽上的修饰位置进行最佳估计。 该软件包的主要编码方式是为了支持此处介绍的工作： <论文发表时引文> 使用这个专案 项目组织 /data ：原始ms / ms数据存储在此处（从未更改） /notebooks ：创建和存储分析笔记本的位置；大部分繁重的代码被分解为源代码 /reports ：从分析笔记本中导出的报告转到此处 /src/msms_structure_annot ：用于在模块中包含和组织自定义源代码的轻量级软件包 拟议的工作流程 拟议的工作流程旨在平衡可重复性，同时仍允许修补MS / MS数据：
【文件预览】：
msms_structure_annot-main
----.gitignore(2KB)
----README.md(9KB)
----environment.yml(460B)
----docs()
--------images()
----LICENSE(1KB)
----postBuild(17B)
----src()
--------README.md(0B)
--------msms_structure_annot()
--------setup.py(389B)
----notebooks()
--------StrA_example.ipynb(16KB)
--------templates()
--------HalA2_example.ipynb(2.03MB)
----data()
--------example_data()