tif转rawmatlab代码-MonolayerKymographs:单层时空动力学分析

时间:2024-06-16 00:14:33
【文件属性】:

文件名称:tif转rawmatlab代码-MonolayerKymographs:单层时空动力学分析

文件大小:140KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-16 00:14:33

系统开源

tif转原始Matlab代码 2017年2月13日 阿萨夫·扎里茨基(Assaf Zaritsky)- 单层时空分析源代码 该存储库包括Matlab源代码和一个测试数据集。 输入:单层迁移实验的时间耗时(相衬) 输出:速度,方向性和协调运动图,伤口愈合率 输入 输入:延时数据的文件名,参数(可选)。 在指定目录中产生输出。 main(filename, params) 所需参数 params.timePerFrame %成像频率:采集的帧之间的时间(分钟)。 params.nRois %要分割的目标区域的数量,1-用于单侧推进单层,2-伤口愈合。 params.pixelSize %Phyiscla像素大小(um)。 params.patchSize %PIV和分段的修补程序分辨率(um)。 在噪声运动估计和降低的分辨率之间进行权衡。 params.nTime %要处理的帧数(例如,对于200分钟,将nTime设置为(200 / params.timePerFrame )。 params.maxSpeed %最大单元速度。 用于PIV分析(um / hr)。 在嘈杂的运动估计与缺少的快


【文件预览】:
MonolayerKymographs-master
----monoLogo1.PNG(33KB)
----matlabSrc()
--------timeLapseAnalysis()
--------utils()
--------mainCoordination.m(3KB)
--------icons()
--------regionGrowingSegmentation()
--------segmentation()
--------bioformats()
--------mainTimeLapse.m(851B)
--------mainRhosin.m(5KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(3KB)

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