文件名称：grinnWeb:用于组学集成的 R 网络应用程序
文件大小：554KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-21 17:01:39
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咧嘴笑 在人类代谢网络的背景下进行组学整合的 R 网络应用程序 版本：1.0（2015 年 3 月 10 日） 描述 grinnWeb 是一个生物信息学平台，包含一个图形数据库和用于代谢组学研究的 R 网络应用程序。 基于 KEGG 的代谢网络，grinnWeb 可以生成两种类型的网络：连接代谢物网络和代谢物、蛋白质、基因和通路的集成网络，用于网络分析和可视化。 使用在线grinnWeb 加州大学戴维斯分校网络下的在线使用，请点击 使用本地grinnWeb 或者对于本地使用，需要安装和 。 按照在本地安装 OpenCPU 服务器。 grinn 内部数据库（本地版本）需要 Neo4j 2.1.5，请给我们发送电子邮件以获取 grinn 数据库文件，目前可用：人类数据库。 下载并解压 将 grinn 数据库文件提取并移动到 Neo4j 服务器目录 启动 Neo4j 服务器，windo
【文件预览】：
grinnWeb-master
----.Rapp.history(20KB)
----grinn.Rproj(335B)
----man()
--------curlRequestUrlToDF.Rd(1011B)
--------queryNode.Rd(1KB)
--------curlRequestCypher.Rd(1KB)
--------getGrinnLocation.Rd(339B)
--------createCyNetwork.Rd(700B)
--------pairToNode.Rd(2KB)
--------curlRequestUrlToList.Rd(994B)
--------integrateNetwork.Rd(2KB)
----NAMESPACE(260B)
----inst()
--------www()
----LICENSE(32KB)
----.Rbuildignore(36B)
----.gitignore(50B)
----R()
--------createCyNetwork.R(2KB)
--------integrateNetwork.R(4KB)
--------queryNode.R(1KB)
--------pairToNode.R(6KB)
--------curlRequestUrlToList.R(1KB)
--------curlRequestUrlToDF.R(1KB)
--------curlRequestCypher.R(1KB)
--------attach.R(11KB)
----DESCRIPTION(317B)
----README.md(2KB)